Přestože výzkumná práce na katedře převažuje, velmi důležitou součástí její aktivity je pedagogická činnost. Je soustředěna na všechny oblasti - pregraduální výuku vojenské toxikologie pro studenty všeobecného lékařství, stomatologie a farmacie, na bakalářské a magisterské studium, na postgraduální výuku a na přednášky různých specializovaných kurzech či školeních, kde jsou přednášky lektorů vyžadovány. Katedra je akreditována pro doktorandské studium. Právě tato specializovaná výuka je oceňována nejen v rámci ČR ale i v zahraničí.