Na poli výzkumu a vývoje profylaktických a antidotních prostředků proti NPL a organofosforovým insekticidům začala nebo pokračovala KTOX ve spolupráci s některými výzkumnými ústavy (Medicinal Science Division, Korea Research Institute of Chemical Technology, Taejon – Korea, Institute for Medical Research and Occupational Health, Zagreb – Croatia, Department of Pharmacology and Therapeutics, Faculty of Medicine and Health Science, United Arab Emirates University, Al Ain – United Arab Emirates, Institute of Pharmacology and Toxicology of Federal Armed Forces Medical Academy Munich – Germany, TNO Prins Maurits Laboratory in Rijswijk – the Netherlands, Department of Toxicology of NBC Research Centre of Military Medical Academy in Sofia – Bulgaria, Centre de Recherches du Service de Sante des Armees /CRSSA/ Grenoble – France). Spolupráce byla charakterizována většinou výměnou informací a bilaterálními stážemi, společnými projekty a v mnoha případech testováním antidot, připravenýchna KTOX, zahraničními institucemi.
V rámci programů cílených k identifikaci mechanizmů chemoprevence prvních fází mutageneze katedra pokračovala ve spolupráci i s Institute of Nutrition Research v Oslu (Norsko) a Institute of Preventive and Clinical Medicine v Bratislavě (Slovenská republika). KTOX byla aktivní i ve spolupráci s organizací pro zákaz chemických zbraní (OPCW) v Haagu (Holandsko).
Příslušníci KTOX jsou členy vydavatelských rad různých časopisů ve světě např. The ASA Review, Acta Medica, Archives of Industrial Hygiene and Toxicology, Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry,Journal of Medical Chemical Biological and Radiological Defense etc., členové vědeckých rad (Scientific Advisory Board, Applied and Sciences Analysis, USA). KTOX získala od NATO Scientific Committee tři granty (Linkage Grants) věnované řešení problémů léčby otrav NPL ve spolupráci s Vojenskou lékařskou akademií v Mnichově (Německo), TNO Prins Maurits Laboratory v Rijswijku (Holandsko) a Vojenskou lékařskou akademií v Sofii (Bulharsko). Podle ISI (USA), výsledky výzkumu katedry byly publikovány ve více než tisíci publikacích a jsou často citovány.
Fakulta vojenského zdravotnictví a KTOX byly organizátory m-CB MTS v Hradci Králové (1997) jako první (a dosud jediná) východoevropská země, schopná zorganizovat takovou akci. Tato schopnost byla potvrzena i v květnu 2005, kdy FVZ organizovala TG-004 NATO Meeting v Hradci Králové. Ve spolupráci s civilními organizacemi proběhla i 8. Česká a Slovenská toxikologická konference v Hradci Králové (3.-5.9.2001) včetně Mezinárodního Symposia o bojových chemických látkách s účastí renomovaných mezinárodních odborníků (USA, Holandsko, Rusko, Francie, Německo a další).
Poslední rok byl pro příslušníky KTOX také úspěšný – byli nominováni jako předsedové sekcí či pozvaní řečníci na různých konferencích nebo vědeckých setkáních na celém světě. Členové katedry jsou také autory 7 kapitol (z celkového počtu 72) knihy editované profesorem Guptou (USA) – „Handbook of Toxicology of Chemical Warfare Agents“ (1147 stran, ISBN 978-0-12-374484-5) vydané v roce 2009 (Elsevier-Academic Press) a autory knihy „Central and Peripheral Nervous System: Effects of Highly Toxic Organophosphates and their Antidotes“, která bude také vydána v roce 2009 (Research Signpost, Kerala; J. Bajgar, Editor. ISBN 978-81-308-0331-9).